講演・講義概要

みなさんは病気の治療法やくすりがどうやって開発されているかしっていますか? 製薬会社がつくる? 医師が開発する? いえいえ、どちらもちがいます。病気の治療法やくすりの開発では、臨床試験とよばれる患者さんを対象とした科学的かつ倫理的な実験を行うことが必須となっていて、臨床統計学の考え方と手法が使われています。 この演習では、実際の肝がん臨床試験を題材として取り上げ、臨床試験とはどんなものであるか、どのような臨床統計学の考え方が使われているのか、について解説し、統計ソフトJMPを使ってこの臨床試験データの解析、次のステップの臨床試験での必要な試験参加者の設計などを行います。

講演・講義概要

バイオインフォマティクスにおいてはDNA配列やタンパク質配列などの 文字列データ、および、遺伝子発現データなどの実数ベクトルデータが 数多く扱われます。 それらの解析では配列データからの機能予測や遺伝子発現データからの 細胞分類などが行われます。 これらの予測や分類のためには様々な機械学習技術を統合したソフトウ ェアツールが利用されています。 広く利用されているツールの一つとして Python 言語上の Scikit-learn があります。 本セミナー・実習では、Scikit-learn とバイオインフォマティクスに おける公開データを用いて、バイオインフォマティクスにおける機械学習 技術の適用法を体験します。

講演・講義概要

本演習では、機械学習の基本を学ぶとともに、実際にデータを扱いながらその動きを確認することで、機械学習に親しむことを目指す。
前半では、機械学習の標準的な問題設定やモデルについて学ぶ。
後半では、データ解析コンペティションの形式で、実際にデータを扱いながら機械学習による予測モデリングの課題に取り組む。

講演・講義概要

本演習では、人体の断面画像であるCT（コンピュータ断層撮影、Computed Tomography） 画像を用いて医用画像処理の導入部分を学びます。画像というと写真や絵、図などを思い 浮かべますが、CT画像は、放射線などを利用して人体の中を走査して構築された3次元情 報を、医師が理解しやすいように連続した複数の断面で画像化したものです。現在、大量 に撮影されるCT画像に対して、異常がないかの診断を迅速かつ高精度に行うため、医用画 像処理の発展が期待されています。具体的には、CT画像の読み込みやフィルタ処理などの 基礎的な技術を体験することで、医用画像処理にふれてもらいます。

[演習ではPythonを利用してウェブブラウザ上で画像処理を行います]