・離散構造を伴う機械学習
集合、系列、リスト、組合せ、グラフ、論理ルール、言語、プログラムなど有限な対象を組み合わせることで生じる離散構造を伴う機械学習の技術研究。ゲノム配列、化学構造、化学反応ネットワーク、遺伝子ネットワーク、分子間相互作用ネットワークなど、生命科学や化学に現れるデータの機械学習や、論理、言語、プログラム、モデルのネットワーク構造や木構造の機械学習など。
・自然科学における機械発見
化学・材料科学や生命科学(分子生物学・細胞生物学・創薬化学・生化学・ゲノム科学)など、自然科学におけるデータ利活用のための機械発見の技術研究及び実践研究。多様なドメイン分野と情報科学(統計科学・計算機科学)を融合する学際的研究に20年以上従事。